2018年05月健保署於辦理全民健保業務時，將其所蒐集之全國民眾納保與就醫資料，釋出予第三者建置健康資料庫，並供學術研究等目的外利用；但該行為卻引起資訊自主與資訊隱私保障之爭議，後續並有相關訴訟之提起。雖然健保署強調該行為係為提升醫療衛生發展與公共利益，但上訴人仍爭執包括告知後同意欠缺、公開透明作業程序不足、新舊法適用爭議、法定職務與公共利益範圍不明確、資訊安全（去識別化）不充分等議題。本文聚焦於台灣最高行政法院一○六年度判字第五四號判決對於公務機關個資操作行為（蒐集、處理、利用）定位、法定職務依據、目的限制原則、去識別化工具之見解，分析整理該號判決對對個資保護之可能影響。
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健保資料庫行政訴訟案：個資保護與健保資料之跨機關流動及二次利用